Bueno como esas cosas que pasan un día podía ver animaciones de Java en mi navegador Epiphany y otro día ya no pude verlas más. ¿Pero cómo, si estaba bien instalado el plugin que había descargado de la página de Sun Java?
En fin nada gana uno con preguntarse mucho las cosas, es mejor buscar una solución.
Lo que solucionó el problema fue entrar a Synaptic y poner "sun" en Buscar. Una vez allí salieron un montón de cosas pero lo que debimos enfocarnos en buscar es:
sun-java6-bin
sun-java6-jre
sun-java6-plugin
Las marcamos e instalamos y volvemos a abrir el navegador.
Para comprobar que funciona podemos hacer una de dos cosas: vamos a una página en la que no hayamos podido ver antes una imagen con java como esta donde debe aparecer esta imagen:
O en la barra de direcciones del navegador podemos escribir:
about:plugins
Esto nos dará una lista de los plugins de nuestro navegador. Buscaremos: libnpjp2.so
Aparecerá algo como así:



